Création du musée, organisation et gestion des collections : note de Pajot sur la création du musée (29 novembre 1935), correspondance (décembre 1935-mars 1943), projet d’arrêté sur la création du musée (s.d.), minute juridictionnelle (1936), arrêté du Résident supérieur en Annam (août 1937), listes (décembre 1938, s.d.), note (janvier 1942), plans du musée (s.d.).

Le fonds AAS reflète l’activité administrative et scientifique de l’École française d’Extrême-Orient depuis sa fondation par arrêté du Gouverneur général de l’Indochine du 15 décembre 1898. Le fonds contient notamment les archives de la direction concernant la gestion et l’organisation de l’EFEO pendant les périodes Indochinoise et parisienne (gestion comptable, du personnel, des immeubles, etc.), et les archives scientifiques produites par le service archéologique et par le service ethnologique et linguistique.
Le sous-fonds des travaux des membres contient notamment les productions scientifiques de certains membres. Un sous-fonds est consacré à la gestion des musées du Vietnam, du Cambodge et du Laos gérés par l’EFEO. Une grande quantité de documents concerne les relations de l’EFEO avec des instituts scientifiques (universités, instituts, musées, écoles, etc) et leurs membres à l'échelle mondiale.