Le fonds a été traité plusieurs fois entre les années 1990 et 2013. Ces traitements ont amené à la production d'instruments de recherche très variés et non conformes aux normes archivistiques. Ces outils sont consultables à la bibliothèque de l’EFEO.

En particulier :

• À partir de 1995 : dépouillement et classement des archives définitives par Mme Rose-Anne Couëdelo (archiviste-paléographe). Travail effectué à titre bénévole;

• En 1995 : Mme Jacqueline Filliozat, travaille à la création d’un guide des archives. Elle a ainsi rédigé un document succinct des archives concernant les manuscrits de la péninsule indochinoise, les Instituts bouddhiques, les Écoles de Pali, les bibliothèques royales et monastiques, les travaux et les correspondances scientifiques des philologues du bouddhisme indochinois ainsi que des documents pour servir à l’histoire des collections des bibliothèques et des musées de l’École. Elle a aussi donné un aperçu des documents archéologiques, paléographiques, ethnologiques et linguistiques ;

• En 1996 : rédaction d’un inventaire sommaire des boîtes d’archives de l’EFEO, réalisé par Nadine Pallois à partir des travaux de Mme Couëdelo et Mme Filliozat;

• Entre 1999-2001 : traitement des archives par Armelle Olivier sous la direction de Mme Couëdelo. Les objectifs étaient la rédaction d’un inventaire, la finalisation du plan de classement, la reconstitution des dossiers et la production d’une liste définitive et détaillée des archives. Ces tâches devaient compléter le travail qui n’avait pu être terminé antérieurement par Mme Couëdelo ;

• En 2002 : classement des archives archéologiques du Cambodge et du fonds Henri Parmentier dans le cadre d’un stage effectué par Brice Vincent sous la direction de Bruno Bruguier, membre de l’école et chargé de la création d’un service de documentation archéologique ;

• En 2013 : stage de trois mois de Mlle Cécile Capot dans le cadre de son Master « Archives - Technologies numériques appliquées à l’histoire » de l’École nationale de Chartes. L’objectif était de retravailler, enrichir et compléter l’inventaire des archives. Compte tenu de la complexité du fonds et du manque de temps, la mission de ce stage a été redéfinie. Ce travail a une importance fondamentale : c’est justement en 2013 que plusieurs pièces d’archives ont été retrouvées, aussi bien dans les magasins que dans les bureaux du personnel. L’outil de recherche rédigé en 2013 figurait, jusqu’au traitement de 2021, sur le site des archives de l’EFEO. Une table de correspondance entre les cotes de 2013 et celles de ce répertoire est disponible en annexe : https://archives.efeo.fr/downloads/aas.pdf

• De mars et décembre 2020, Sovannara Mey (archiviste vacataire) s’est occupé du fonds de la Conservation d’Angkor dont plusieurs cartons ont été extraits du fonds « Archives historiques » ;

Les archives ont donc été fractionnées lors des différents traitements : les archivistes ont travaillé sur la totalité des fonds et à partir de 2019 on a commencé à extraire les deux fonds des Conservations d’Angkor et du Cambodge-Cochinchine au regard de la demande croissante de consultation par les chercheurs. Aucune trace du classement original (datant de la période de constitution du fonds) des documents ne subsiste aujourd'hui sauf les n° de section indiqués sur les « chemises historiques ». Ce dernier indique le thème général ou l’objet des documents.

Ce répertoire est le résultat du dernier traitement du fonds entre septembre 2020 et août 2021.