Gestion des collections et fonctionnement du musée : correspondance (décembre 1923-juin 1944), pièces graphiques (s.d.), arrêté du Gouverneur général de l’Indochine (décembre 1927, octobre 1929), arrêtés du Résident supérieur en Annam (septembre-décembre 1934), listes des pièces (s.d), rapports sur le fonctionnement du musée (février 1928, 1930, 1935, 1948, s.d.), réglementation du musée (novembre 1934), note sur le fonctionnement du musée (1934), liste des sculptures à envoyer au musée (septembre 1937, s.d.), rapport de réunion (1940).
Cession des collections préhistoriques et éthologiques : correspondance (janvier 1939), note (s.d.).

Mission de Mme Auboyer au musée du Cambodge : correspondance (décembre 1958-décembre 1959), coupure de presse (février 1928), note concernant le réaménagement du musée par Mme. Auboyer (février 1929), avant-projet de création d’un musée à Siem Reap (février 1929), plan du musée (s.d.).

Organisation de la session et renseignements : ordre du jour (s.d.), note (s.d.), correspondance (novembre 1952-février 1954), procès verbal (1953), rapport sur les activités de l'EFEO (février 1954).

Organisation de la session et renseignements : correspondance (décembre 1953-juin 1954), procès verbal (1953), arrêté du Gouverneur général de l’Indochine (avril 1954), arrêté du premier ministre du Royaume du Laos (mai 1954), ordre du jour (s.d.), plan d'action (février 1954).

Organisation des sessions et renseignements : correspondance (janvier 1957-décembre 1963), pièce comptable (1957), procès-verbaux (1956-1964),pièces comptables (1960-1964), rapports d’activités (1961-1964).

CA : Séances 1982-1989, Séance du 23 janvier 1990, Séance du 26 juin 1990, Séance du 8 janvier 1991, Séance du 5 juin 1991, Séance du 17 septembre 1991
CS : Séances des 19 mai, 29 juin et 17 octobre 1989, Séance du 23 janvier 1990, Séance du 26 juin 1990, Séance du 8 janvier 1991, Séance du 5 juin 1991, Séance du 17 septembre 1991

Organisation des séances : correspondance (décembre 1955-juillet 1956), rapport sur le déroulement des séances du conseil de liquidation (juin 1956, s.d.), procès-verbal de la séance (s.d.), pièces comptable (mai 1956), listes de récapitulation générale des versements des quatre États pendant la période quadriennale 1951-1954 (février 1955, février 1956).

Registres portant sur la correspondance confidentielle envoyée au directeur de l'EFEO ou lui étant adressée en "copie conforme". Les destinataires et les expéditeurs sont divers (Gouverneurs généraux de l'Indochine, Résidents, Conservateur d'Angkor, etc.) ainsi que les objets des lettres (examens des langues, organisations des foires, demandes d'emploi, etc).

Correspondance avec : M. O’kelly, Henri Oger, Commandant d’Ollone, M. Patte, M. Paris, M.Pelliot, Michel Raineau, M. Rivet, Edmond Rottach, M. Ruffier, Herni Russier, Emile Senait, M. Silice, M. Silvestre, M. Simonin, M. Soulie, M. Souvignet, M. Stein, M. de la Susse, M. Taffarin, R.P. Tandart, L. Taubali, P. Tissot, Louis La Vallée Poussin, M. Vallez et M. Villarem.

Correspondance avec : Académie des sciences coloniales, Association des étudiants et anciens étudiants de Marseille, Cité universitaire, Comité français des sciences historiques, Congrès international des sociétés de géographie économique, Délégation générale à la recherche scientifique et technique, Direction du personnel du Gouvernement général de l’Indochine, Fondation Étienne, Groupement des intérêts coloniaux, Institut colonial de Marseille, Musée des arts africains et océaniens, Musée Guimet, Office d’échanges internationaux de travaux scientifiques, Union coloniale française, Union nationale du commerce extérieur, Société asiatique, Société de géographie commerciale de Paris, Société des élèves sinologues de Lyon, Société de géographie et d'études coloniales, Société de Linguistique de Paris, Société française de Fouilles Archéologiques, Société nationale d’Acclimatation de France.