Les archives de la Conservation Cochinchine-Cambodge comprennent trois sous-fonds :

1. Administration générale : deux dossiers de correspondances.
2. Activités et recherches de terrain :
   • Les rapports de fouilles : ils renseignent la direction de l’EFEO et le gouvernement du Cambodge des travaux et recherches en cours. Ils sont mensuels avec quelques rapports trimestriels.
   • Les journaux de fouilles : Au nombre de 2 registres de petits formats et un registre de grand format. Ils sont parmi les éléments les plus importants du fonds. Ils contiennent le récit, jour après jour, des travaux et recherches menés. Ils permettent la continuité du travail et est propre à la fonction de conservateur et non au conservateur lui-même. Ils ne concernent que la période allant de 1931 à 1933.

La collection d'images populaires vietnamiennes de l'EFEO est issue de collectes réalisées par des membres et des personnels vietnamiens de l'Ecole, dans les années 1950. Maurice Durand, Paul Lévy, Louis Bezacier, Trán văn Giáp et Trán Huy Bá ont ainsi constitué une collection de plus de 550 images.
Produits essentiellement pour la fête du nouvel an sino-vietnamien (fête du Tết), ces documents iconographiques sont mises en vente quelques jours avant la nouvelle année. D'autres périodes de production sont attestées, même si elles sont moins dynamiques (images d'automne, images de souhaits, etc.). Enfin, la collection comporte de nombreuses images religieuses, dont les techniques de fabrication sont identiques.
Les thèmes abordés par ces images sont variés : images religieuses, historiques, éducatives, images de beaux paysages, satiriques, de souhaits et images-talismans.
Imprimées par un procédé xylographique sur du papier journal, les images sont ensuite renforcées par contre-collage de plusieurs feuilles.

Généralités sur les citadelles de Cochinchine : catalogue des 26 plans des Citadelles (s.d.), correspondance (mars-juillet 1912).
Plans des citadelles Baria, Bien Hoa, Chau-doc, Hà-Tiên, Go-Cong, My-tho, Saigon, Tay-Ninh, Thu-Dau-Mol, Vinh-Long (1817-1912, s.d.).

Plans, photographies, notes et correspondance à propos des citadelles de Binh-dinh, Binh-Thuan, Khan-Hoa, Ha Tinh, Hué, Nghé-an, Phu-Yen, Thanh-Hoa, Quang-binh, Quang-Nam, Quang-Ngai et Quang-tri.

Liste des provinces (s.d.)

Généralités sur les monuments de la province du Bình Thuận : correspondance (novembre 1900-septembre 1929), inventaire des monuments historiques du Bình Thuận (juin 1924).
Bronzes de Dans-Binh et tour chams de Phu-Hai, découverte : correspondance (novembre 1924-janvier 1944).

Généralités sur les monuments de la provinve du Bình Định : documents graphiques (s.d.), correspondance (octobre 1921-mars 1930), notes sur les inscriptions (s.d.), inventaire des monuments par village (1929), extraits des chroniques du BEFEO tomes XVIII et XXX [1918-1930].
Explorations et découvertes sur les sites de Bình Định : correspondance (novembre 1926-septembre 1943).

Mission d’études pour l’établissement de l’inventaire détaillé des monuments khmers au Laos et au Cambodge, exécution et prolongation : correspondances (juin 1932-décembre 1934, s.d.), rapport sur la Grotte de Ban Na Pheng (s.d.), décision (janvier 1934), étude sur le Yunnan Fou (s.d.).
Vente d’objets anciens du Cambodge : inventaires des pièces (1923-1924, s.d.), correspondance (février 1923-août 1925, s.d.), procès verbal (août 1925).
Manifestation d'art khmer : brochure (1950).
Collection de sculptures khmères acquise au 1938-1939 par les musées royaux d’art et d’histoire de Belgique, envoie : correspondance (septembre- octobre 1949), liste des objets (s.d.).
Céramiques khmères du musée international de céramique de Faenza, donation : correspondance (décembre1951-avril 1952).
Inventaire général d'art khmer (1987).